Water gecirculeerd door het filter wordt gereinigd in twee fasen: eerst puin en grote deeltjes worden verwijderd door het schuim spons (mechanische filtratie), ten tweede door het vullen van de media container met ofwel koolstof (die zuiverheid en helderheid van het water verbetert) of keramische media (voor bacteriën kolonisatie die het nitraatgehalte controleert).